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动植物基因组学大会(Plant and Animal Genome Conference,PAG)是全国上最大的农业基因组会议,同期亦然国外动植物基因组学规模的迫切嘉会。PAG始于1994年,亦然东谈主类基因组谋略开动的第四年,每年一月都在好意思国圣地亚哥的“城乡度假会议中心”(Town & Country Resort and Convention Center)举办。

除疫情时期2022年停办一年,PAG已走过了32个年初,行动全球动植物基因组学规模规格最高、范围最大的年度会议,毅然成为全球动植物基因组学筹商者同样和展示最新科研着力的迫切平台。频年来,PAG会议进一步加强了国外化和多元化的发展,除主会议在好意思邦原土举办,还在亚洲等地区缔造分会,如PAG Asia会议,以更好地知足不同地区筹商东谈主员的需求。


本次大会为期6天,共有超100家展商,220个学术论坛,1200张海报摘抄,超3200学者和从业东谈主员进入。单从扶植商来看,超大型国外种业集团GDM、Bayer、Corteva和Limagrain领衔扶植,测序厂商和就业商紧随后来。

PAG为全球动植物基因组学筹商者提供了一个展示和同样最新筹商着力的平台,为不同国度和地区的筹商东谈主员设置了庸俗的合营关系,促进了资源和数据的分享,加快了科研着力的产出和应用。PAG会议展示了基因组学在农业、畜牧业、生物技能等规模的应用筹商着力,信得过作念到了产学研和科研回荡的良性轮回。
行动一个“巨无霸”会议,PAG涵盖的实质卓绝全面且多元,涵盖了花式生物、畜禽、水生生物、作物、微生物等基因组的最新筹商阐扬,同期也展示了最新的基因组测序技能、基因剪辑技能、基因组学大数据分析用具等。
以下回来了这次会议的一些样子焦点:
01
“泛基因组”和“T2T”

△ 部分泛基因组论说

△ 部分T2T论说
本次大会,泛基因组(Pan-genome)筹商皆备短长常活跃的议论规模,34个主题论说,46个poster abstract高居榜首。T2T基因组(Telomere-to-Telomere Genome)遍布了猪、牛、羊、马、骡子等常见经济动物和秋葵、西瓜等经济作物。长读长技能在动植物基因组规模的爆发式应用,让泛基因组的筹商成为当下最热点的话题。
测序技能的高速发展,让动植物科研职责者不祥更全面地分析物种内的遗传千般性,揭示基因组中的复杂重迭序列和结构变异,从而清爽复杂性状的遗传基础,维持精确的基因剪辑和育种谋略,加快新品种的开导。
02
“分享”和“定约”
相较于东谈主类基因组筹商的弥漫经费,动植物基因组筹商经常掣襟露肘,数据分享和统一筹商的迫切性无庸赘述。通过数据分享,科研东谈主员不祥拜谒和应用全球范围内的基因组、转录组、甲基化组等多种组学数据,从而更全面地清爽动植物的遗传千般性和生态合乎性。此外,统一筹商促进了不同学科和地区的科学家之间的合营,使得筹商不祥打破单一施行室的门径,汇注更多的资源和智谋,加快科学发现和改动。
本次大会有两个比拟特理由的定约与人人分享一下:
Animal Breeding-RCN

Animal Breeding RCN(Research Collaboration Network)是一个专注于牲畜、家禽和水产动物基因组筹商的科研合营集会。该名目旨在通过经常的会议和同样,协长入优先接洽动物基因组筹商,识别收敛迫切性状的基因区域和基因,并将筹商着力与全球科学家分享。其绸缪是进步农场动物分娩的着力和效果,为全球食粮可握续性作念出孝顺。RCN主要样子四个筹商规模:基因组测序、功能详实、基因组暗示和精确表型组学与育种。
FarmGTEx
FarmGTEx(Farm Animal Genotype-Tissue Expression)名目是一个国外性的科研合营名目,旨在为家养动物构建一个全面的分子表型QTL数据库。该名目通过全球科学家的合营,悉力于于发现收敛农场动物迫切性状的基因区域和基因,从而匡助咱们更好地浮现迫切经济性状以及环境合乎性的分子遗传机制。名目分为试点阶段(2018-2023年)、主要阶段(2022-2033年)和增强阶段(2022年于今),谋略侦察每个牲畜物种逾越50种组织/细胞类型中的逾越1000个个体,以摈弃对调控景不雅过火对经济价值复杂性状影响的全面视图。


△ 部分PigGTEx着力
03
低廉、低廉、更低廉
行动全球最大的农业基因组大会,繁多种业企业皆聚一堂,样子着基因组学在经济物种上的回荡应用。关于价钱顶点敏锐的农业规模,老本收敛是亘古不变的主题。自2001年Meuwissen初度将全基因组聘请(Genome Selection)应用于分子育种规模,提供“最全、最准确、最低廉”的基因分型技能成为一众从业东谈主员的追求。


△ 部分低深度全基因组测序的论说
低深度全基因组测序(Low-pass WGS)正成为一种迫切的基因分型设施,它通过低老本的测序战略,对群体中通盘个体进行全基因组低深度重测序和变异查找,再应用连锁反抗衡(Linkage Disequilibrium,LD)对缺失的序列进行臆测和基因型填充,最终获取大范围样本全基因组水平的高密度基因象征。这种设施不仅减少了测序数据量和老本,还能通过基因型填补得到全基因组范围内的高密度SNP,知足高SNP密度和大样本量的需求,性价比更高。

本次会议上,华大智造子公司Complete Genomics在分论坛上分享了AgriHigh低深度全基因组测序组合产物在猪、牛、水稻上的应用数据,得到了庸俗样子。收敛2024年12月,华大已破译动植物基因组超5100种,约占到全球总孝顺值的41%。
该组合产物是一套专为农业科研和育种应用而开导的全过程组合产物,包括硬件、软件和试剂,涵盖“核酸索要-建库-测序-生信分析”过程,配备生动组合的自动化决策,可知足不同的通量需求。与传统建库设施不同,AgriHigh汲取全新的板式建库试剂盒,仅需三步(打断、贯穿反馈、等体积搀和)即可摈弃大范围建库,极地面裁减建库时候。

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试用肯求日历:即日起至2025.3.31
参考贵府:
[1] https://www.animalgenome.org/RCN/?tab=obj
[2] https://www.farmgtex.org/
[3] https://intlpag.org/PAG32/